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首頁 > 核酸生物學 > PCR相關 > 2×GC buffer

2×GC buffer

2×GC buffer

產品編號(hao):RTB3101-01

產品規格:1ml

相關規格:
數量
價格(ge) ¥0

2×GC Buffer

     產品組成:

目錄號

規格

價格

RTB3101-01

1ml





RTB3101-03

10×1ml

300元(yuan)

保(bao)存:-20

用途:

PCR 擴增復雜結構的 DNA 片(pian)段(duan)。

產品說明和(he)注意事項(xiang):

1. 本產(chan)品能與各(ge)種(zhong)PCR酶配合(he)使用,能夠擴(kuo)增(zeng)具有復雜二(er)級(ji)結構模板(GC rich、重復序(xu)列等(deng))的PCR片段。

2. 使用 GC Buffer 進行 PCR 擴增時,建(jian)議使用 Tm 值較高的引物。因此,引物最好設計(ji)在 30 mer 左右。

3. 使用 GC Buffer擴增的 GC rich 的(de)DNA 片段長度(du),會因(yin) GC 含量不同而各有差異。

4. 由于 GC Buffer 和一般的PCR Buffer 相比 DNA 變性效果較強,因此,一般的 DNA片段(duan)(GC含量低于50%的目的片段)不(bu)推薦(jian)使用2×GC buffer進行擴增

使用說明:

1. 按照(zhao)下表在0.2ml PCR管中(zhong)制(zhi)備反應體系:

 

成分

25μl反應體(ti)系

50μl反應體系(xi)

終濃度

Template

0.05-0.5 μg

0.1-1 μg

as you wish

Primer 110 μM

0.5 μl

1 μl

200nM

Primer 210 μM

0.5 μl

1 μl

200nM

2×GC buffer

12.5 μl

25 μl

dNTP Mixture(10 mM)

0.5 μl

1 μl

200μM each

Taq (5 U/μl)

0.25-0.5 μl

0.5-1 μl

2.5-5U

ddH2O

up to 25 μl

up to 50 μl

-

2. 混勻后,離心(xin)快甩(shuai)將反應液收集到管底。

3. PCR儀如果沒有熱蓋加熱的話(hua),補加25μl礦物(wu)油。

4. PCR儀上執行(xing)以下程序:

兩步法:

步(bu)驟

溫度

時間

循環數(shu)

初始變性

94

5 min

1

變性

94

30 sec

25-40*

退火和延伸

68

1 min/kb

最后延(yan)伸

72

5 min

1

*注: PCR 反應條件視模板、引物等的結構條件不同而各異。在實際操作中需根據模板、目的片段的大小、堿基序列和引物的長短等具體情況,設定最佳的反應條件(溫度、時間等)。



1. 怎樣確定擴增片段的GC含量大小(xiao)?

   推薦使用Oligo軟件(jian)分(fen)析片段的GC含量(liang)(如(ru)下圖所(suo)示)

 

2. 2×GC buffer能擴(kuo)增(zeng)正常GC含量片段嗎?

2×GC buffer可以擴增GC含量正常的模板。然(ran)而(er),由(you)于(yu)GC buffer有比較強的(de)變(bian)性效(xiao)果(guo),因此(ci)一般的(de)模板使用GC buffer擴增時,有時會降低擴增效率(lv)。

3. 2×GC buffer能兼容大(da)多(duo)數PCR用(yong)酶嗎?

2×GC buffer能兼容大多數PCR酶,比如TaqTaq plusLong Taq等,可以(yi)根據片段長(chang)度以(yi)及(ji)保真性要求選擇(ze)不同的(de)酶。

4. 使用GC buffer擴增時,為什么推薦使用兩步(bu)法?

由于目的片(pian)段GC含量高(gao),引物的(de)Tm值(zhi)往往會比較高,在(zai)PCR時(shi),當(dang)退火溫(wen)度和延伸溫(wen)度差距較小時(shi),比如(ru)退火溫(wen)度超過60時,退火溫(wen)度和(he)延伸溫(wen)度可以設成同一數值(zhi),一般(ban)為(wei)68





2×GC buffer
lane 1-5: Rice 390bp fragement(GC% 77.1%)
lane 6-10: Rice 760bp fragement(GC% 72.9%)
lane 1 and 6: TaKaRa 2×GC buffer I
lane 2 and 7: TaKaRa 2×GC buffer II
lane 3 and 8: RTB3101 2×GC buffer
lane 4 and 9: RTB3106 10×Taq PCR buffer
lane 5: Rice 390bp,RTB3101 2×GC buffer, 三(san)步法擴增(zeng)
lane 10: Rice 760bp,RTB3101 2×GC buffer, 三步法(fa)擴增




 
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