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高分子量蛋白(大于150 kD)Western Blot攻略

高分子量蛋白(大于150 kDWestern Blot攻略

注:該文引自基因幫公眾號天才試劑君文章,略有修改。  Ver.730875

選對凝膠很重要

三種最常見的凝膠系統包括Tris-Glycine, Bis-Tris and Tris-Acetate系統。

Tris-Glycine凝膠的pH8.6,且保質期很短,一般4-8℃保存有效期一個月。在跑膠的過程中,凝膠系統的pH還有上升的趨勢,可達到9.5,這(zhe)會導致蛋白降解(jie)和低(di)分(fen)辨率。

Bis-Tris凝膠的pH~6.5,相對Tris-Glycine凝膠,穩定性和保質期都有所增加,4-8℃貯存可以保存一年。但這種凝膠更適合于低分子量電泳分離(低于200 kD),不適(shi)合高分子量(liang)蛋白(bai)電泳。

Tris-Acetate 凝膠的pH~7,跑大分子蛋白會呈現很高的分辨率,同時4-8℃貯存(cun)可以保存(cun)一年。

所以跑大分子蛋白時,我們推薦使用Tris-Acetate 凝膠(貨號:RTD6162RTD6155)。

凝膠濃度很重要

既然選擇了Tris-Acetate 凝膠,要考慮凝膠濃度的問題。凝膠濃度與孔徑成反比:濃度越小,孔越大,較大的蛋白質更容易通過較大的孔,所以建議使用低百分比的Tris醋酸凝膠(貨號:RTD6162),如6%等度膠。也可以使用梯度凝膠,但是制作梯度凝膠會恨棘手,需要一個梯度凝膠生成系統(貨號:RT-GZY02),不過現在很多公司都會出售具有不同范圍的梯度預制膠(貨號:RTD6155),節省時間。

電泳內槽緩沖液需要添加抗氧化劑

Tris-醋酸電泳使用10×Tris-醋酸-SDS電泳緩沖液(貨號:TA050),經典的Tris-甘氨酸-SDS電泳緩沖液無法兼容使用。由于DTTpH中性時,基本不隨著樣品泳動,為保證蛋白樣品在電泳中維持還原力,Tris-Acetate 凝膠電泳時,電泳槽內槽緩沖液需要添加抗氧化劑(貨號:TA1510),這樣可以保(bao)證整個電泳過(guo)程中(zhong)蛋(dan)白的變(bian)性還原狀(zhuang)態,提高樣品的分(fen)辨率。

● 四 提高轉膜緩沖液中的SDS,減少甲醇

高分子量蛋白轉膜緩沖液中的組成至關重要。如果有甲醇存在,大分子蛋白很容易沉淀,可以通過減少轉膜緩沖液中的甲醇百分比(10%或更低)來避免這種情況發生。為了進一步確保蛋白質不會沉淀,考慮在轉膜緩沖液中添加SDS至終濃度為0.05%-0.1%。SDS向蛋白添加均勻的負電荷,使得它們更容易從凝膠轉移到膜上。高分子量蛋白的轉膜緩沖液可以選擇10×Tris-醋酸轉膜緩沖液(濕轉,粉末型)(貨號:TA5030P

● 五 選擇合適的轉印膜

轉印膜一般有PVDF膜或NC膜,跑大分子蛋白建議選擇PVDF膜。如前面所說,如果有甲醇存在,大分子蛋白很容易沉淀。而PVDF膜可以不需要在轉膜緩沖液中添加甲醇,目的蛋白轉印的機會更高。PVDF膜有各種孔徑尺寸,最常見的是0.22 μm和0.45 μm。與凝膠一樣,較大的蛋白比較小的蛋白更容易穿過大孔隙。高分子量蛋白質可以用0.45μm膜(貨號:ML-PV-131545-5)轉(zhuan)移,避免使(shi)用0.22 μm孔(kong)徑(jing)。

● 六 增加轉印時間

在正確的選擇完凝膠、轉印膜及轉移緩沖液后,轉印正式開始。半干轉快且方便,但不適用于大分子蛋白。大分子蛋白建議濕轉,因為大分子蛋白轉移時間很慢,推薦350-400 mA轉移90 min 4℃,40 mA,轉印過夜。

● 七 關于轉印膜封閉

沒有任何一種封閉試劑能通用于蛋白封閉。BSA通常作為NC膜的封閉液,但是對于PVDF膜,它的封閉效果并不是最好。大蛋白轉膜后的封閉可以選擇5%脫脂奶粉(貨號:WN1070)。

另外,不要讓PVDF膜(mo)在檢測過程中的任(ren)何時間點干(gan)透(tou),如果膜(mo)部分變干(gan),可以讓膜(mo)完全干(gan)掉,然后(hou)用甲(jia)醇重新(xin)潤濕(shi),之后(hou)用緩(huan)沖(chong)液浸(jin)泡,繼續操作。