Blue Native PAGE凝膠電泳常見問題
Blue Native PAGE凝膠電泳常見問題
1. 在非變性條件下,使用Blue
Native PAGE凝膠進行非變性電泳比使用Tris-甘氨酸凝膠具有哪些優勢?
需要使用非離子洗滌劑進行增溶的樣品不能兼容傳統的非變性Tris-甘氨酸PAGE,因為隨著蛋白質在聚丙烯酰胺凝膠中的遷移,會將非離子洗滌劑遺留在條帶上方。當缺少非離子洗滌劑時,蛋白質會聚集并在泳道頂部形成垂直線條。當使用藍色非變性電泳(Blue Native PAGE凝膠)時,Coomassie G-250可顯著減少蛋白質的聚集,有效分離膜上的蛋白質復合物,達到Tris-甘氨酸凝膠上得不到的效果。此外,與Tris-甘氨酸系統的工作pH(pH 9.3–9.5)相比,Blue
Native PAGE凝膠較低的工作pH(pH 7.5–7.7)有助于維持堿性pH敏感型蛋白質的非變性結構和/或活性。
2. Blue
Native PAGE凝膠應如何保存?
我們推薦將其保存在4-8℃。不可冷凍。
3. Blue
Native PAGE凝膠的蛋白分離范圍是多少?
3-12%RealPAGE Native BN/CN 預制膠可分離(li)分子量(liang)在(zai)45–10,000 kD范圍(wei)內的蛋白質。
4-16%RealPAGE Native BN/CN 預制(zhi)膠可(ke)分(fen)離分(fen)子(zi)量(liang)在25–10,000 kD范(fan)圍內(nei)的蛋白(bai)質。
4. Blue
Native PAGE凝膠的推薦樣品上樣體積和蛋白質上樣量是多少?
我們提供的預制膠是12孔,每個孔的最大上樣體積為30 μl,推薦每個泳道的蛋白含量范圍在20-50 μg。
5. 我的Blue Native PAGE凝膠在電泳過程中停止電泳了,為什么?該如何繼續電泳?
在Blue Native
PAGE凝膠電泳期間,電流下降至低于1 mA很常見。有些電泳電源如伯樂電源有負載檢查功能,電流過低(低于4mA) 會認為沒有負載,報錯E1錯誤代碼,終止電泳。解決方法是更換電泳電源,如使用國產電源;另外可以調高電壓高于300 V,使得電流不要低于4mA。
6. Blue Native電泳有配套的蛋白Marker嗎?
推薦使用RTD6137 非變性電(dian)泳(yong)蛋白質Marker(45-880 kD),RTD6142 高分子量非(fei)變性電泳蛋白質Marker II(45-669 kD)或者RTD6144 寬分子量非變性電泳蛋白質Marker 21-880 kD。然而由于凝膠濃度較低(di),低(di)于45 kD條帶(dai)會壓在(zai)前沿,可能不(bu)可見。
在Blue Native
PAGE電泳中,不能使用預染分子量Marker,因為所有的預染蛋白分子量Marker都是經過變性和還原的,在非變性凝膠上不能良好分離。
請注意,即使使用非變性分子量Marker,在非變性電泳中的分子量預估也是非常不精確的,因為各蛋白質的不同電荷和結構會嚴重影響凝膠遷移。為獲得更精確的預估,可使用質譜分析或排阻層析(SEC)。
7. 你們推薦對Blue Native PAGE凝膠使用哪種染色方法?
Blue Native PAGE凝膠可兼容大多數標準Coomassie
R-250或G-250染料配方。推薦使用FastBlue蛋白染色液(貨號:RTD6202)。
8.
5% G-250染料的作用是什么?是否含有洗滌劑?
5% G-250染料(貨號BC260)是一種濃縮型Coomassie G-250儲液,專為與含有洗滌劑(非離子型)的Blue Native
PAGE凝膠電泳樣品一起使用而設計。該染料不含洗滌劑。正常情況下,非變性蛋白在凝膠上的遷移取決于凝膠緩沖液pH下的自然電荷/等電點,但是,加入Coomassie G-250會使蛋白質產生負電荷,即使是通常具有正電荷的高pI蛋白質也能帶上負電。該添加劑能夠與蛋白質非特異性結合,能夠保持蛋白的非變性狀態。
9. 你們推薦選擇哪種轉膜緩沖液用于Blue Native PAGE凝膠轉印?
我們推薦選擇10×BN轉膜緩沖液(貨號:BC600P)用于Blue Native PAGE凝膠轉印。PVDF是推薦使用的印跡膜,具有良好的轉印和檢測效果。硝酸纖維素膜(NC膜)不能兼容Blue Native PAGE凝膠轉印,這是因為硝酸纖維素膜可與Coomassie
G-250染料發生緊密結合,很難脫離干凈。
10. 對于Blue Native PAGE凝膠,你們推薦的轉膜條件是什么?
由于Blue Native
PAGE電泳基本關注的是分子量比較大的蛋白或復合體,推薦使用濕轉法轉膜(貨號:RT-ZY01),不推薦用半干轉方法轉膜。使用BN轉膜緩沖液,以下轉膜條件僅供參考,客戶針對自己的目的蛋白,最好經過1-2次預實驗后,確定最佳的轉膜條件。
蛋白大小
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穩(wen)流
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建議時間
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降溫(wen)措施(shi)
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低于70kD
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150 mA
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1 小時(shi)
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不需要
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70-300 kD
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200 mA
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1.5-2 小(xiao)時
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需(xu)要
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高于(yu)300 kD
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200 mA
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2.5-3.5 小時
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需要
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11. 凝膠轉膜后,我的PVDF膜染上藍顏色了怎么辦?
由于電泳緩沖液和上樣緩沖液中含有考馬斯亮藍G-250,凝膠轉膜后PVDF膜會有藍色痕跡,可以把膜浸泡在無水甲醇中漂洗幾分鐘,去除藍色。
12. 非變性Marker轉到膜上看不到條帶,Western Blot檢測后我如何判斷條帶大小呢?
有兩種方法可以解決非變性Marker轉(zhuan)膜后條帶顯示問題:
第一種方法:凝膠轉膜后用麗春紅染色液(貨號:RTD6301)染膜,可以看到Marker條帶,順便可以檢測轉膜效率,然而要注意的是麗春紅染色靈敏度比較低,可能不能完全看到完整的Marker條帶。
注:北京師范(fan)大學惠贈圖片
第二種方法(下圖):電泳結束后,把含有Marker泳道的凝膠切下,單獨用FastBlue蛋白染色液(貨號:RTD6202)染色,剩余的凝膠去完成轉膜到ECL發光檢測過程,最后的發光結果和Marker染色結果拼接判斷條帶范圍。
Jurkat細胞BN電泳 GAPDH檢測
電泳:1×藍色電泳緩沖液(含0.01% G-250)
穩壓150V 43分鐘;1×無色電泳緩沖液 穩壓150V 35分鐘
轉膜:1×BN轉膜緩沖液(不含甲醇),穩流200 mA
(電壓72-60V) 1.5小時,未冰浴
膜漂洗去藍色:PVDF膜無水甲醇浸泡10分鐘至膜無色
一抗:GAPDH兔多抗(貨號:
RGA1040),1:5000 過夜孵育
二抗:羊抗兔IgG-HRP(貨號:
HGR1020) 1:5000 RT 1小時
ECL檢測:ECL發光(貨號:
EC2520),曝光3.5 min